GDL

Journal from gdlhub / 2017-11-11 11:20:49
Oleh : Bahrul Ulum, Wisnu Ananta Kusuma, Joni Prasetyo, Kursor
Dibuat : 2017-11-11, dengan 1 file

Keyword : Selulase, Multiple Sequence Alignment, Perancangan Prime
Url : http://journal.trunojoyo.ac.id/kursor/article/view/1084/910
Sumber pengambilan dokumen : WEB

Selulase mempunyai peranan utama dalam pemanfaatan limbah biomassa yang mengandung lignin, hemicellulose, dan cellulose (lignocellulose). Limbah biomassa ini sangat banyak terdapat di lingkungan dan sampai saat ini masih belum dimanfaatkan secara maksimal, dikarenakan banyak mikroorganisme dari alam yang memproduksi enzim selulase dengan jumlah terbatas (aktifitasnya rendah). Dalam rangka meningkatkan produktivitas mikroorganisme untuk menghasilkan selulase, salah satu cara yang dapat diterapkan adalah merancang primer sekuens gen penyandi selulase yang dirangkum dari beberapa mikroorganisme penghasil selulase. Dalam penelitian ini, kami melakukan penyejajaran sekuen DNA penyandi selulase untuk mencari potensial primer untuk meningkatkan produktivitas enzim selulase dengan teknik Multiple Sequence Alignment (MSA). Metode yang digunakan adalah metode progresif (Progressive Alignment Algorithms). Hasil penelitian menunjukan bahwa pada tahap penyejajaran, didapatkan tiga daerah konservatif (conserved regions). Sedangkan pada tahap perancangan dengan beberapa parameter yang telah ditentukan didapatkan 46 pasang primer dari lima sekuen gen penyandi selulase yang didapat dari National Center for Biotechnology Information (NCBI)

Deskripsi Alternatif :

The role of cellulase is very important in degrading cellulose which is abundant in the environment, such as in biomass waste that is containing lignin, hemicellulose, and cellulose. Biomass waste is abundant in the environment and is still not fully utilized, because many of the natural microorganisms that produce cellulase enzymesproduce the enzyme in a limited amount (have low activity). In order to improve the productivity of microorganisms in producing cellulase, one of the ways that can be applied is to design primer sequences of genes encoding cellulase summarized from several cellulase-producing microorganisms. In this research,we perform alignment of DNA sequences coding of cellulase to look for potential primer in order to increase the productivity of cellulase enzymes by Multiple Sequence Alignment (MSA) method. The method used is progressive (Progressive Alignment Algorithms). The results showed that in the alignment phase, three conserved regions were obtained. However, in the planning phase by using some predetermined parameters 46 pairs of primer sequences were obtained from five genes encoding cellulase taken from NCBI

Beri Komentar ?#(0) | Bookmark

Properti	Nilai Properti
ID Publisher	gdlhub
Organisasi	Kursor
Nama Kontak	Herti Yani, S.Kom
Alamat	Jln. Jenderal Sudirman
Kota	Jambi
Daerah	Jambi
Negara	Indonesia
Telepon	0741-35095
Fax	0741-35093
E-mail Administrator	elibrarystikom@gmail.com
E-mail CKO	elibrarystikom@gmail.com